高二教师安辰在课后开办了一个“秘密补习班”，只接收成绩垫底但拥有特殊天赋的学生。数学白痴却精通黑客技术的林夜、英语零分但能通灵的古小月、物理不及格却会预知未来的周一天……安辰用自己的方式教他们“应试”，同时隐藏着一个秘密：他自己是一名被开除的前特工，这个补习班是为了培养下一代“特殊人才”的掩护。当黑暗势力追查到学校，师生们不得不联手，用各自的能力守护彼此。
期末考试前夕，林夜入侵学校系统盗取试卷，被安辰发现后怒斥：“能力要用在正途！”但林夜说他已经把正确答案替换成了更难的题，因为“那些简单题配不上我们班”。结果全班只考了平均分，但无人作弊。
古小月在补习班看到黑影，预知有人会伤害安辰。她整夜不敢睡，守在安辰家门口，结果发现只是邻居家的猫。安辰知道后没有笑她，而是教她“结界冥想”，让她安心。
周一天每天预言第二天的考试题，安辰顺势用“预知题”教学，结果周一天预言到自己会迟到，故意早起，反而第一个到教室。他困惑：“我改变了未来？”安辰微笑：“这就是教学的意义。”
黑衣人来学校调查安辰，安辰不得不带补习班学生躲进地下密室。学生们第一次知道老师的过去，不但没有害怕，反而兴奋地问：“老师，你会飞檐走壁吗？”安辰无奈：“我是文职。”
黑衣人包围教室，学生们利用各自能力——林夜黑掉监控、古小月制造幻觉、周一天预判行动路径——帮助安辰突围。安辰看着这群孩子，第一次觉得特工生涯没有白费。
危机解除后，安辰决定继续秘密教学，但这次他坦白了身份。学生们说：“管你是什么，反正你教得还行。”安辰推了推眼镜，笑了。